Yeni hesaplama aracı iDOMO ilaç sinerjisi tahminini iyileştirir
Icahn Tıp Fakültesi’ndeki Mount Sinai araştırmacıları, karmaşık hastalıklar için kombinasyon terapilerinin tahminini iyileştirmek ve geliştirmek için güçlü bir hesaplama aracı olan iDOMO’yu geliştirdi. Briefings in Bioinformatics dergisinde yayımlanan çalışma, iDOMO’nun gen ifadesi verilerini kullanarak ilaç kombinasyonlarını tanımlama yeteneğini vurguluyor ve mevcut yöntemleri aşıyor.
İlaç keşfini hesaplama yaklaşımlarıyla ileri taşıma
Karmaşık durumlar, kanser gibi hastalıkları tedavi etmek için birden fazla ilacın farklı yollara hedef alındığı kombinasyon terapileri giderek daha önemli hale gelmektedir. Ancak etkili ilaç çiftlerini deneysel olarak belirleme süreci maliyetli ve zaman alıcıdır. iDOMO, bir biyolojik örneğin belirli genlerin aktivite seviyelerini ölçen gen ifadesi verilerini ve hastalık durumu gibi belirli bir durumla ilişkilendirilen gen imzalarını analiz ederek hesaplama bir çözüm sunar. İlaçların ve hastalıkların gen imzalarını karşılaştırarak iDOMO, ilaç kombinasyonlarının yararlı ve zararlı etkilerini tahmin eder.
Yaklaşımımız, insan hastalıklarını tedavi etmek için yeni tedavi seçenekleri olarak hizmet edebilecek ilaç kombinasyonlarını tahmin etmek için daha etkili bir yol sunmaktadır. Bu, standart tedavilere yanıt vermeyen hastalar için tedavi seçeneklerini genişletip klinik uzmanlar için sonuçları iyileştirebilir.”
Bin Zhang, PhD, Kıdemli Yazar, Willard T.C. Johnson Araştırma Profesörü ve Mount Sinai Hastalık Modelleme Merkezi Direktörü
Üçlü negatif meme kanserinde doğrulama
Çalışma, özellikle agresif ve tedavi edilmesi zor olan bir kanser türü olan üçlü negatif meme kanserine iDOMO’yu uyguladı. Model, trifluridin ve monobenzon adlı umut verici bir ilaç kombinasyonunu tanımladı ve bu kombinasyon daha sonra in vitro deneylerde test edildi. Bulgular, bu kombinasyonun tek başına herhangi bir ilaçtan daha etkili bir şekilde üçlü negatif meme kanseri hücre büyümesini engellediğini doğruladı.
“iDOMO gibi hesaplama yaklaşımlarını kullanarak, en umut verici ilaç kombinasyonlarını daha fazla deneysel doğrulama için önceliklendirebilir ve geniş bir hastalık yelpazesinde yeni tedavilerin keşfini hızlandırabiliriz,” Dr. Zhang ekledi.
Tıp ve araştırma için etkiler ve gelecek yönelimler
iDOMO, klinik uzmanlara daha fazla tedavi seçeneği sunarak, konvansiyonel tedavilere dirençli hastalar için yeni ve daha etkili tedavilerin geliştirilmesine yol açabilir. Yakın zamanda keşfedilen ilaç çiftlerini tanımlamak için maliyet etkin ve ölçeklenebilir bir çözüm sunan yaklaşım, çeşitli hastalıklar üzerinde daha geniş uygulamalar için yol açmaktadır.
Gelecekteki çalışmalar, iDOMO’nun uygulamasını üçlü negatif meme kanseri dışındaki diğer hastalıklara genişletmeye, tahmin yeteneklerini daha da geliştirmeye ve bunu geniş ilaç geliştirme süreçlerine entegre etmeye odaklanacaktır.
Kaynak: Dergi referansı: Zhou, X., et al. (2024). iDOMO: identification of drug combinations via multi-set operations for treating diseases. Briefings in Bioinformatics. doi.org/10.1093/bib/bbaf054.
